RasMol 2.7.5

Giấy phép: Miễn phí ‎Kích cỡ tệp: N/A
‎Xếp hạng người dùng: 3.8/5 - ‎5 ‎Phiếu

Dự án SourceForge OpenRasMol là một phụ trợ cho dự án RasMol và OpenrasMol tại http://rasmol.org. Hy vọng rằng dự án SourceForge OpenRasMol sẽ cung cấp một đầu mối thuận tiện cho những đóng góp hợp tác tích cực. RasMol Tính năng, đặc điểm: RasMol là một chương trình đồ họa phân tử dành cho việc hình dung protein, axit nucleic và các phân tử nhỏ. Chương trình nhằm mục đích trưng bày, giảng dạy và tạo ra những hình ảnh chất lượng xuất bản. RasMol chạy trên một loạt các kiến trúc và hệ điều hành bao gồm Microsoft Windows, Apple Macintosh, UNIX và hệ thống VMS. Các phiên bản UNIX và VMS yêu cầu màn hình X Windows màu 8, 24 hoặc 32 bit (X11R4 trở lên). Phiên bản X Windows của RasMol cung cấp hỗ trợ tùy chọn cho hộp quay số phần cứng và tăng tốc giao tiếp bộ nhớ được chia sẻ (thông qua phần mở rộng XInput và MIT-SHM) nếu có trên X Server hiện tại. Chương trình đọc trong một tập tin tọa độ phân tử và tương tác hiển thị các phân tử trên màn hình trong một loạt các bảng màu và đại diện phân tử. Hiện nay có sẵn đại diện bao gồm sâu cued wireframes, 'Dreiding' gậy, spacefilling (CPK) lĩnh vực, bóng và thanh, rắn và sợi ruy băng phân tử sinh học, nhãn nguyên tử và bề mặt chấm. Phiên bản X Windows của RasMol cung cấp hỗ trợ tùy chọn cho hộp quay số phần cứng và tăng tốc giao tiếp bộ nhớ được chia sẻ (thông qua phần mở rộng XInput và MIT-SHM) nếu có trên X Server hiện tại. Chương trình đọc trong các tập tin tọa độ phân tử và tương tác hiển thị các phân tử trên màn hình trong một loạt các đại diện và bảng màu. Các định dạng tệp đầu vào được hỗ trợ bao gồm định dạng Protein Data Bank (PDB), Định dạng Alchemy và Sybyl Mol2 của Tripos Associates, định dạng tệp Mol của Molecular Design Limited (MDL), định dạng XYZ (XMol) của Trung tâm Siêu máy tính Minnesota, định dạng CHARMm, định dạng CIF và tệp định dạng mmCIF. Nếu thông tin kết nối không được chứa trong tệp, thông tin này được tính tự động. Các phân tử nạp có thể được hiển thị như liên kết wireframe, xi lanh 'Dreiding' dính liên kết, alpha-carbon dấu vết, không gian làm đầy (CPK) lĩnh vực, băng phân tử vĩ mô (hoặc mịn bóng băng rắn hoặc sợi song song), hydro liên kết và đại diện bề mặt chấm. Nguyên tử cũng có thể được dán nhãn với chuỗi văn bản tùy ý. Conformers thay thế và nhiều mô hình NMR có thể được đặc biệt màu sắc và xác định trong nhãn nguyên tử. Các phần khác nhau của phân tử có thể được đại diện và tô màu độc lập với phần còn lại của phân tử hoặc được hiển thị trong một số biểu diễn cùng một lúc. Các phân tử hiển thị có thể được xoay, dịch, phóng to và z-cắt bớt (slabbed) tương tác bằng cách sử dụng một trong hai con chuột, các thanh cuộn, dòng lệnh hoặc một hộp quay số đính kèm. RasMol có thể đọc một danh sách chuẩn bị các lệnh từ một tập tin 'kịch bản' (hoặc thông qua giao tiếp giữa các quá trình) để cho phép một hình ảnh nhất định hoặc quan điểm được khôi phục một cách nhanh chóng. RasMol cũng có thể tạo một tập lệnh có chứa các lệnh cần thiết để tái tạo hình ảnh hiện tại. Cuối cùng, hình ảnh kết xuất có thể được viết ra trong một loạt các định dạng bao gồm cả raster hoặc vector PostScript, GIF, PPM, BMP, PICT, Sun rasterfile hoặc như là một kịch bản đầu vào MolScript hoặc Kinemage. Cơ sở trợ giúp RasMol có thể được truy cập bằng cách gõ "trợ giúp" hoặc "trợ giúp

lịch sử phiên bản

  • Phiên bản RasMol_2.7.5 đăng trên 2010-12-15
    Một số bản sửa lỗi và cập nhật
  • Phiên bản RasMol_2.7.5 đăng trên 2010-12-15

Chi tiết chương trình