Chương trình theo t2prhd.sf.net

t2prhd là một kịch bản Perl mà tạo ra sơ đồ đơn giản mà làm nổi bật các mối quan hệ của chuỗi lặp đi lặp lại phát hiện bằng cách sử dụng một hồ sơ HMM trong hai chuỗi. Quan hệ đồng tính được xác định trên cơ sở phát sinh loài