Chương trình theo scape3d.sf.net

3DScape là plug-in đầu tiên cho phép trực quan hóa mạng ba chiều trong Cytoscape. Các tính năng của 3DScape bao gồm truy cập giao diện đồ thị, thuật toán bố cục và hiệu ứng hoạt hình trên một loạt dữ liệu biểu thức.